Gezer, konakladığı evde cüzdan, kimlik ve telefon gibi kişisel eşyalarını bırakarak dışarı çıktıktan sonra bir daha geri dönmedi. Ailesinin durumu jandarmaya bildirmesi üzerine, arama çalışmaları başlatıldı. İlçe Jandarma Komutanlığı, AFAD ve diğer arama-kurtarma ekipleri, iz takip ve kadavra köpekleriyle birlikte bölgede kapsamlı bir arama gerçekleştirdi. Ancak yapılan çalışmalardan sonuç alınamadı. Kış mevsimi ve zorlu arazi koşulları nedeniyle arama çalışmalarına bir süre ara verildi. Sonunda, 16 Mayıs 2025 tarihinde, Karaağaç köyünün kuzeydoğusundaki ormanlık alanda Murat Gezer'in cansız bedenine ulaşıldı. Gezer’in cenazesi, otopsi için Adli Tıp Kurumu’na kaldırıldı. Şavşat Cumhuriyet Başsavcılığı, olayla ilgili adli soruşturma başlattı. Bu trajik olay, kaybolan kişilerin bulunması için yapılan arama çalışmalarının önemini bir kez daha gözler önüne serdi.